发布日期：2026-06-01
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兔狲（Otocolobus manul），亦称帕拉斯猫，是猫科中最为神秘的物种之一，主要栖息于青藏高原及中亚高海拔荒漠、草原地带。该物种被列入 CITES 附录II，在中国被列为国家二级重点保护野生动物，全球种群呈碎片化分布且数量持续下降。由于该物种隐蔽的生活习性及高海拔栖息地难以抵达，兔狲是猫科动物中研究最少的类群之一，其高海拔适应的遗传基础知之甚少。
研究人员通过将 PacBio HiFi、Illumina 与 Hi-C 技术相结合，首次成功组装了兔狲的de novo染色体水平基因组。结果显示，组装得到的基因组大小为 2.55 Gb，contig N50 达96.32 Mb，98.02%的序列被挂载到 19 条染色体上，BUSCO 完整性评估达 97.60%，共注释出 22,699 个蛋白质编码基因（图1）。系统发育分析显示兔狲属与豹猫属（Prionailurus）形成姐妹枝，二者分化时间约为6.10–7.04百万年前（图2）。值得注意的是，核基因组系统发育树表明兔狲属与豹猫属亲缘关系最近，而线粒体基因组则显示兔狲属与猫属（Felis）亲缘关系更近。基于全基因组和线粒体基因组的基因流分析均表明兔狲与其他支系之间的基因流趋近于零（m ≈ 0），从而排除了基因流导致这种核-质系统发育不一致性的可能性，推断该冲突主要源于不完全谱系分选（ILS）（图3）。这一发现再次印证了仅依赖线粒体基因组来解决物种分化历史结果的不可靠性，并强调了在系统发育研究中整合多组学数据的必要性。
图1. 兔狲基因组特征
图2. 兔狲的系统发育关系和进化分析
图3. 兔狲的核基因组以及线粒体基因组系统发育关系
国家重点实验室祁得林课题组提出兔狲高海拔适应的分子机制：通过增强 HIF-1 介导的氧感知与响应、优化糖酵解及能量代谢效率来适应高海拔低氧环境，同时通过增强代谢效率和蛋白质稳态等策略应对低温胁迫。该研究获青海省科技厅“帅才科学家”负责制项目（2024-SF-102）及青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室开放基金（2022-KF-09）资助，研究成果于2026年5月25日以Chromosome-Level Genome Assembly of Otocolobus manul Provides Insights Into High-Altitude Adaptation and Evolutionary Traits为题发表于Zoologica Scripta。
Shuo Feng, Xin Tang (co-first), Qiang Gao, Xin zhang Qi*, Delin Qi*, Chromosome-Level Genome Assembly of Otocolobus manul Provides Insights Into High-Altitude Adaptation and Evolutionary Traits. Zoologica Scripta, 2026. DOI: 10.1111/zsc.70066.
